张店物流公司和整车收费方式在以下几个方面存在区别：

    服务范围：物流公司通常提供更广泛的物流服务，包括仓储、配送、运输等多个环节，而整车收费方式主要针对整辆车的货物运输服务。
    收费标准：物流公司的收费标准通常根据多个因素综合计算，包括货物重量、体积、运输距离、运输方式、服务等级等，而整车收费方式则主要根据车辆的承载能力和运输距离来计算。
    服务质量：物流公司通常提供更加全面和专业的物流服务，包括对货物的包装、装卸、搬运等环节的监管和管理，而整车收费方式则主要关注货物的安全和准时到达目的地。
    价格透明度：物流公司的收费标准通常比较透明，客户可以提前了解各项费用明细，而整车收费方式则需要客户与物流公司协商确定价格。
    适用范围：物流公司适用于各种类型的货物运输，包括散货、零担和整车的运输，而整车收费方式则主要适用于大批量货物的整车运输。

综上所述，物流公司和整车收费方式在服务范围、收费标准、服务质量、价格透明度和适用范围等方面存在区别。在选择物流服务时，客户需要根据自身需求和预算进行综合考虑，选择适合自己的物流公司和收费方式。